近年來，市編辦按照中央、省市關于推進縣級公立醫院綜合改革工作要求，積極部署、主動作為，從機構編制資源配置、公立醫院運行體制、縣級公立醫院職能定位等多方面入手，著力推進縣級公立醫院改革。
一是科學核定縣級公立醫院編制。核編工作中，同衛生部門一起，一方面嚴格執行編制標準，從緊從嚴核定編制，切實減少領導職數，降低行政成本；另一方面，堅持因地制宜，綜合考慮各縣（市）區公立醫院床位數、等級、類別和門診量等多種因素，由市編辦核定總量，各縣（市）區分期分批下達，并對承擔公共醫療衛生服務任務較重的醫院給予適當傾斜。
二是建立和完善法人治理結構。在總結平陰縣中醫院法人治理結構試點經驗的基礎上，加大對縣（市）區的指導力度，科學界定政府和公立醫院在資產、人事、財務等方面的責權關系，積極探索建立理事會等法人治理結構形式。今年又在市群眾藝術館、市美術館（濟南畫院）、市圖書館建立了公共文化機構理事會。
三是積極推進縣級公立醫院去行政化。明確縣（市）區衛生計生行政部門負責人不得兼任區級公立醫院領導職務，對已兼職的，明確清理時限，要求2015年12月31日前辭去公立醫院或衛生計生行政部門職務。
四是進一步擴大改革試點面。聯合市衛計委、財政局、人社局、發改委、物價局等六部門出臺《長清區區級公立醫院綜合改革試點實施意見》，明確長清區成為繼章丘、平陰、濟陽、商河后，濟南又一推進公立醫院綜合改革試點的區縣，將全面深化區級公立醫院管理體制、補償機制、價格機制、藥品采購、人事編制、收入分配、醫保制度、監管機制等方面的綜合改革，以期建立維護公益性、調動積極性、保障可持續性的運行新機制。